Унутрашње уређење и рад Вишег суда у Шапцу регулише се Судским пословником, а његовом применом обезбеђује се уредно и благовремено обављање послова судске управе и других послова важних за унутрашњу организацију и рад суда.
Организационе јединице:
1. Судска управа
2. Писарница
3. Служба за информатику и аналитику
4. Рачуноводство
5. Дактило-биро
6. Техничка служба
